有機質含量是判斷有機肥質量的一項重要指標，如果在發酵有機肥時沒有達到足夠的有機質含量，就會影響有機肥的質量，那麽應該如何增加有機肥的有機質含量呢？

　　一、選用含有微生物的肥料發酵劑。當前許多有機肥生產廠家，用來生產發酵有機肥的物料都是雞糞、牛糞和作物秸稈等。養殖戶在養殖過程中為了給畜禽創造幹爽的環境，會在沒有清理的糞便中加入爐渣和泥沙等無機物質，而且在畜禽的糞便中本身還含有粗纖維、粗蛋白和未被畜禽消化的飼料成分。傳統發酵是很難完全分解這些物質的，並且發酵不完全。

　　二、在發酵物料中添加一些有機質含量高的物質，如：鋸末和糠醛渣等。鋸末和糠醛渣中碳源豐富，但是傳統發酵也是很難發酵充分且發酵時間長，降低了鋸末和糠醛渣的可利用率。肥料發酵劑中的微生物菌種，在好氧碳氮比為30:1的環境條件下可大量繁殖和工作，將鋸末糠醛渣充分發酵，增加有機肥中含氮化合物和碳水化合物等成本，還增加了有機肥中的有機質。

　　三、在發酵物料中添加腐殖酸類物質。腐殖酸是有機質的主要組成成分，但是腐殖酸溶於水和弱酸，這就對發酵環境有了一定的限製。